崔磊磊
时间：2020-10-30 11:49:00 来源：作者：
崔磊磊 助理研究员
研究方向：数量遗传学 线粒体遗传与人类衰老
Github网站：https://github.com/LeileiCui
教育经历
2020.02 - 2023.02，英国，伦敦大学学院，数量遗传学和线粒体遗传，博士后
2015.12 - 2017.11，英国，伦敦大学学院，家猪/大鼠/小鼠非加性遗传结构，联培博士
2014.04 - 2014.07，荷兰，瓦赫宁根大学，全球猪种种群结构及基因交流，学术访问
2012.09 - 2018.07，江西农业大学，猪遗传改良与养殖技术国家重点实验室，动物遗传育种与繁殖（硕博连读），农学博士
2008.09 - 2012.07，江西农业大学，信息与计算科学，理学学士
工作经历
2019.11 - 至今，南昌大学，人类衰老研究所，助理研究员
2024.03 - 至今，南昌大学，生科院教职工第二党支部，支部副书记
2021.07 – 2022.07，南昌大学，生科院研究生第三党支部，支部书记
相关科研项目
1. 国家重点研发计划，2023YFF1001000，“农业动物杂种优势形成的生物学基础”，2023/7-2027/12，在研，子课题负责人。
2. 国家自然基金青年项目，32402720 , “整合多组学数据解析家猪复杂性状非加性遗传结构”，2025/01-2027/12，在研，主持。
3. 江西省自然基金青年项目，20242BAB20307，“整合多组学数据解析家猪显性遗传结构”，2024/06-2026/05，在研，主持。
4. 国家自然基金重点项目，82330046，“染色体促长寿基因簇互作减缓动脉粥样硬化的分子机制”，2024/01-2028/01，在研，参与。
5. 国家自然基金地区项目，31760657，“利用高通量测序数据解析猪4号染色体影响生长和胴体性状位点的分子机理”， 2018/01-2021/12，已结题，参与。
6. 国家自然基金面上项目，31572379，“解析猪12号染色体上影响肌肉脂肪酸C14:0和C16:0含量主效位点的分子机理”， 2016/01-2019/12，已结题，参与。
7. 国家自然科学基金地区项目，31460283，“解析猪7号和15号染色体影响猪皮厚主效基因位点的分子遗传机理”，2015/1-2018/12，参加，已结题。
8. 江西省科技厅重大专项，20152ACB21001，“基于全基因组重测序技术的藏猪高原适应性的分子遗传机理研究”，2015/1-2017/12，参加，已结题。
代表论文著作
1. Fang L, Teng J, Lin Q, Bai Z, Liu S, …, Cui L, et al. The Farm Animal Genotype-Tissue Expression (FarmGTEx) Project. Nature Genetics, 2025.
2. Teng J, Gao Y, Yin H, Bai Z, Liu S, Zeng H, The FarmGTEx-PigGTEx Consortium, …, Cui L, et al. A compendium of genetic regulatory effects across pig tissues. Nature Genetics, 56 (2024), 112-123.
3. Cui L, Yang B, Xiao S, Gao J, Baud A, Graham D, McBride M, …, Mott R, Huang L. Dominance is common in mammals and is associated with trans-acting gene expression and alternative splicing. Genome Biology, 2023, 24(1):215.
4. Yang J*, Cui L*(co-first author), …, Yang B, Huang L. Unravelling the genetic basis for skeletal muscle mitochondrial DNA copy number variations in pigs. SCIENCE CHINA Life Sciences, 2023, 1674-7305.
5. Cui L, Yang B, Pontikos N, Mott R, Huang L. 'ADDO: a comprehensive toolkit to detect, classify and visualize additive and non-additive Quantitative Trait Loci'. Bioinformatics, 36 (2020), 1517-1521.
6. Yang B*, Cui L*(co-first author), et al. Genome-wide SNP data unveils the globalization of domesticated pigs [J]. Genetics Selection Evolution, 2017, 49(1): 71.
7. Xu P*, Cui L*(co-first author), Huang T, et al. Genome-wide identification of quantitative trait transcripts for blood traits in the liver samples of a White Duroc × Erhualian F2 pig resource population, Physiological Genomics, 48 (2016), 573-579.
8. Cui L, Zhang J, et al. Sexually dimorphic genetic architecture of complex traits in a large-scale F2cross in pigs [J]. Genetic Selection Evolution, 2014, 46(1):76.
9. Ai H, Fang X, Yang B, Huang Z, Chen H, Mao L, Zhang F, Zhang L, Cui L, He W, et al, 'Adaptation and Possible Ancient Interspecies Introgression in Pigs Identified by Whole-Genome Sequencing', Nature Genetics, 47 (2015), 217-25.
10. R. Keele, W. Prokop, H. He, K. Holl, J. Littrell, A. Deal, S. Franic, L. Cui, et al. ‘Genetic Fine-Mapping and Identification of Candidate Genes and Variants for Adiposity Traits in Outbred Rats’. Obesity, 2018, 26(1):213.
11. W. Zhang, J. Zhang, L. Cui, J. Ma, C. Chen, H. Ai, X. Xie, L. Li, S. Xiao, L. Huang, J. Ren, and B. Yang, 'Genetic Architecture of Fatty Acid Composition in the Longissimus Dorsi Muscle Revealed by Genome-Wide Association Studies on Diverse Pig Populations', Genet Selection Evolution, 48 (2016), 5.
12. R. Qiao, J. Gao, Z. Zhang, L. Li, X. Xie, Y. Fan, L. Cui, J. Ma, H. Ai, J. Ren, and L. Huang, 'Genome-Wide Association Analyses Reveal Significant Loci and Strong Candidate Genes for Growth and Fatness Traits in Two Pig Populations', Genet Selection Evolution, 47 (2015), 17.
研究方向
主要从事数量遗传学和生物信息学研究方向，致力于新型GWAS模型和软件的开发（性别特异性遗传位点--性别与基因的互作，显性/超显性遗传位点--等位基因的互作等），以及并应用于多种哺乳动物群体（人类、大鼠、小鼠、家猪），解析多种复杂性状（生长、肥胖、骨骼、免疫、血液和焦虑等）的遗传结构，以及哺乳动物线粒体遗传学，熟悉多种组学数据的分析流程（基因组、转录组、全长转录组、微生物组等），对复杂性状遗传定位分析经验丰富：（1）Variants Detection（2）Phenotype-Genotype Association Analysis（3）QTL Fine Mapping（4）Causal Variants Filtering（5）Causal Variants Verification（6）Molecular Mechanism Analysis。
曾获荣誉
Ø 赣江青年学者
Ø 江西省优秀博士论文
Ø 国家留学基金委留学奖学金
Ø 博士研究生国家奖学金
学术兼职
北美华人遗传学会、国际种业科学家联合体会员，担任Ageing Cell、Bioinformatics、Advanced Biology、Bioinformatics Advances、BMC Genomics、BioData Mining、Plos One和Frontier in Genetics等国际期刊审稿人。